そんなとき「世一」は、「日本フットボール連合」と呼ばれる組織から、強化指定選手として招集されます。

しかしその現場には300人もの高校生が…。

しかも全てがFWである「ストライカー」のポジションで、メンバーの中には名の売れた選手が何人もいました。

するとみんなの前には、「絵心甚八（えご じんぱち）」と呼ばれる青年が現れます。

「甚八」は、自身をW杯優勝のために雇われた人間だと説明して、世界一の「ストライカー」を作る実験をすると宣言します。

さらに「青い監獄（ブルーロック）」施設で、300人のなかから、1人の世界的な「ストライカー」を作ると言って、世界的な有名な「ストライカー」がわがままであることを引き合いに、みんなに対してわがままな「エゴイスト」になれと告げます。

そして「甚八」は、300人の選手を「青い監獄（ブルーロック）」招き入れ、特殊な選考や訓練を行っていきます。

そのなかで「潔世一」は、さまざまな仲間やライバルたちと競い合い、「ストライカー」のあるべき姿を理解して、新たな能力を開花させていくのでした…。